Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms