Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3O55013 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms