Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DffaO54786 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DffaO54786 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DffaO54786 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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DffaO54786 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DffaO54786 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DffaO54786 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DffaO54786 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DffaO54786 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DffaO54786 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DffaO54786 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DffaO54786 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DffaO54786 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DffaO54786 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DffaO54786 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DffaO54786 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DffaO54786 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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DffaO54786 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DffaO54786 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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DffaO54786 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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DffaO54786 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DffaO54786 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DffaO54786 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DffaO54786 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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DffaO54786 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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DffaO54786 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DffaO54786 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DffaO54786 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DffaO54786 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DffaO54786 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DffaO54786 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DffaO54786 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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DffaO54786 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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DffaO54786 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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DffaO54786 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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DffaO54786 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DffaO54786 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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DffaO54786 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DffaO54786 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DffaO54786 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DffaO54786 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DffaO54786 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DffaO54786 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DffaO54786 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms