Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd2O35927 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms