Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sp100O35892 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp100O35892 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sp100O35892 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sp100O35892 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sp100O35892 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sp100O35892 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sp100O35892 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sp100O35892 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sp100O35892 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sp100O35892 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sp100O35892 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sp100O35892 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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