Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Ptpn9O35239 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Ptpn9O35239 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Ptpn9O35239 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Ptpn9O35239 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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Ptpn9O35239 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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Ptpn9O35239 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Ptpn9O35239 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Ptpn9O35239 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Ptpn9O35239 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Ptpn9O35239 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Ptpn9O35239 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Ptpn9O35239 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Ptpn9O35239 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Ptpn9O35239 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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