Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArxO35085 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArxO35085 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArxO35085 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArxO35085 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ArxO35085 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ArxO35085 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArxO35085 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArxO35085 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArxO35085 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArxO35085 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArxO35085 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ArxO35085 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ArxO35085 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ArxO35085 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ArxO35085 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ArxO35085 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArxO35085 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArxO35085 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArxO35085 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ArxO35085 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms