Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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