Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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