Protein–RNA interactions for Protein: K7N749

Gm8229, Predicted gene 8229 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8229K7N749 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8229K7N749 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms