Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5225J3QPL3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5225J3QPL3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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