Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20873J3QMQ9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms