Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms