Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SmgcF6VRN1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms