Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5861F6VCN9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms