Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrdnE9Q9K5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrdnE9Q9K5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms