Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms