Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brd1E9PZ26 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms