Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r177E9PXM3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms