Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms