Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms