Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms