Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CatipB9EKE5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatipB9EKE5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms