Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll11A4Q9F4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms