Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc4a11A2AJN7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms