Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms