Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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SYCP1Q15431 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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SYCP1Q15431 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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