Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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BRD3Q15059 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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BRD3Q15059 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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BRD3Q15059 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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