Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NME3Q13232 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NME3Q13232 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NME3Q13232 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms