Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXQ1Q9C009 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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FOXQ1Q9C009 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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FOXQ1Q9C009 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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