Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF17Q9BXT8 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF17Q9BXT8 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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