Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CENPFP49454 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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CENPFP49454 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CENPFP49454 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CENPFP49454 THSD7B-201ENST00000272643 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CENPFP49454 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CENPFP49454 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CENPFP49454 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CENPFP49454 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CENPFP49454 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CENPFP49454 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CENPFP49454 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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CENPFP49454 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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CENPFP49454 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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CENPFP49454 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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CENPFP49454 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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