Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms