Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms