Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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