Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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VAPAQ9P0L0 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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VAPAQ9P0L0 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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VAPAQ9P0L0 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VAPAQ9P0L0 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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