Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms