Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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