Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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