Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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