Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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