Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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CDH18Q13634 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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CDH18Q13634 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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