Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SLC10A2Q12908 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms