Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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