Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP29Q9HBJ7 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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