Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BHLHE41Q9C0J9 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms