Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms