Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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FAM200BP0CF97 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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FAM200BP0CF97 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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FAM200BP0CF97 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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FAM200BP0CF97 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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FAM200BP0CF97 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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FAM200BP0CF97 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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FAM200BP0CF97 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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FAM200BP0CF97 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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