Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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COPS7AQ9UBW8 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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COPS7AQ9UBW8 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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