Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.8 ms